Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms