Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HERC1Q15751 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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