Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
TRIP13Q15645 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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TRIP13Q15645 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIP13Q15645 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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