Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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