Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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