Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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