Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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MKRN4PQ13434 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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MKRN4PQ13434 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
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MKRN4PQ13434 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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MKRN4PQ13434 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
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