Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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