Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MSH5O43196 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MSH5O43196 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MSH5O43196 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MSH5O43196 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MSH5O43196 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
MSH5O43196 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MSH5O43196 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MSH5O43196 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MSH5O43196 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MSH5O43196 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MSH5O43196 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MSH5O43196 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MSH5O43196 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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