Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms