Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FXNQ16595 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FXNQ16595 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FXNQ16595 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FXNQ16595 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms