Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF2H3Q13889 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms