Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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