Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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