Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SRSF5Q13243 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms