Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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FOXF1Q12946 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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FOXF1Q12946 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF1Q12946 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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