Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms