Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms