Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms