Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PGGT1BP53609 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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