Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD12P35452 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD12P35452 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms