Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRGP23470 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms