Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC88CQ9P219 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms