Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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