Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SALL3Q9BXA9 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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