Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BBS9Q3SYG4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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