Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SGCBQ16585 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SGCBQ16585 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SGCBQ16585 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SGCBQ16585 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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SGCBQ16585 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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