Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SKIV2LQ15477 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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