Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
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RYR3Q15413 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RYR3Q15413 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RYR3Q15413 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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