Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHD4Q14839 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms