Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms