Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms