Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CUL1Q13616 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CUL1Q13616 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CUL1Q13616 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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