Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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