Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOBRQ0VD83 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms