Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
IFFO1Q0D2I5 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
IFFO1Q0D2I5 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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