Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP53609 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms