Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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