Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTF1AQ7RTS3 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms