Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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