Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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ECM1Q16610 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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ECM1Q16610 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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ECM1Q16610 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ECM1Q16610 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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ECM1Q16610 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ECM1Q16610 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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