Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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