Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
ITGA7Q13683 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms