Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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CHAF1BQ13112 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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