Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms