Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SP6Q3SY56 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SP6Q3SY56 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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