Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CSPP1Q1MSJ5 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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