Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HMGN3Q15651 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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