Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHD4Q14839 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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CHD4Q14839 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
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CHD4Q14839 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
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CHD4Q14839 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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CHD4Q14839 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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CHD4Q14839 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHD4Q14839 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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