Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF2H3Q13889 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms